细胞株
SKOV 3细胞(源于腹水的人卵巢腺癌)来源于美国型培养物(ATCC)。细胞在Dulbecco改良的Eagle‘s培养基(DMEM)中培养和保存,附加10%胎牛血清(FCS),2mm。L谷氨酰胺、青霉素100 U/mL、链霉素100 g/mL。细胞保持在37°C和5%CO2。所有试剂都是从吉布科或热科学公司购买的(Paisley,英国)。细胞常规检测支原体(每3-6个月一次)。
SKOV 3细胞受体表达的流式细胞术分析
SKOV 3细胞密度为1.5×105在一个96井的平板中每口井的细胞。细胞用200 L的洗涤液(pbs/1%BSA)洗涤,与含1:500抗人抗人单克隆抗体(RmcB,Milli孔隙,Watford,UK)的100 L洗涤液,小鼠抗人单克隆抗叶酸结合蛋白抗体(克隆EPR 4708(2))(克隆EPR 4708(2))(克隆EPR 4708(2))或小鼠IgG控制抗体(德国海德堡圣克鲁斯生物技术公司(Santa Cruz BioTechnology,Heidelberg,德国))孵育1h。细胞洗涤3次,用1:500稀释的山羊抗小鼠AlexaFluor 647抗体(英国Invitrogen)孵育30 min。细胞在4°C固定于4%多聚甲醛中20 min,共2×10。4门控事件在BD Accuri C6(BD生物科学,美国)流式细胞仪上的FL-4频道获得,数据用BD Accuri C6软件版本1.0.264.21(Becton Dickinson,美国)进行分析。流式细胞术分析CAR与FR结合情况,并与IgG同工型结合。
噬菌体库
−12博士、−7博士和−C7C噬菌体展示肽库是从新英格兰生物多样性图书馆购买的。随机十二肽(Ph.D.−12)和七肽(Ph.D.−7和Ph.D.−C7C)的组合文库与M13噬菌体的小外壳蛋白(PIII)融合。所显示的肽(分别为12-聚体和7-聚体)在PIII的N端表达.图书馆由1×10组成13空斑形成单位(PFU)/mL噬菌体(含10)9随机序列产生每个序列的100拷贝。
噬菌体生物筛选
5×10接种SKOV 3细胞5DMEM 6孔板,10%FCS,37°C,5%CO培养的细胞2。24h后,细胞冷却至4°C 30 min。细胞用冷PBS清洗两次。噬菌体库添加量为2×1011噬菌体总体积为1mL DMEM/1%BSA,4°C温和摇动1h,去除未结合噬菌体(4°C保存)。细胞在PBS/1%BSA中洗4次2 min。在PBS(100 g/mL)中加入1mL叶酸(Acros organics,Fisher Science,UK)洗脱结合噬菌体,在4°C下竞争抑制1h。噬菌体在4℃保存,待分析(未扩增洗脱液)。对未扩增的噬菌体进行标记,以确定每一轮生物筛选的成功与否。
噬菌体滴度
在37°C,150 rpm条件下,在罗里亚贝塔尼(LB)肉汤中用四环素隔夜培养一个ER 2738菌落。未扩增噬菌体十倍系列稀释液(10)1–104)在LB中,一夜之间就准备好并添加到ER 2738种培养物中。将噬菌体在室温下孵育1~5 min,转至含4°C琼脂糖顶3mL的试管中。在短暂的漩涡后,将细菌培养倒入预先加热的LB/IPTG/Xgal平板上,冷却5 min,第二天在37°C下孵育一夜,计数菌斑形成单位数。
噬菌体扩增
将ER 2738菌群与四环素在37°C,150 rpm的LB液中过夜培养,在20 mL LB中加入3mL的隔夜培养液,加入未扩增的洗脱液。37℃,150 rpm扩增噬菌体。培养以10,000 rpm(12,000×)离心。g)4°C培养20 min,上清液转入新鲜试管离心。上清液上清液80%(~19 mL)转入新鲜管,加入1/6体积(~3mL)PEG/NaCl。噬菌体在4℃下一夜沉淀。
PEG沉淀
PEG沉淀于10,000 rpm离心15 min,4°C离心15 min,上清液丢弃,再作短暂离心,去除残留上清液。噬菌体再悬浮于1mL TBS中,每分钟1,000转离心,4°C离心5 min,上清液经1/6体积(~166 L)PEG/NaCl沉淀,冰孵育30 min,4°C离心13,000 rpm,10 min离心,上清液丢弃,离心去除残留上清液。球团在0.025 NaN的200升中重新悬浮。3离心1 min,制成颗粒残留不溶性物质。在扩增的洗脱液中,将上清液转移到干净的管中。扩增后的洗脱液按上文所述,用10标记。8–1011扩增噬菌体洗脱液稀释液。
菌斑扩增纯化
未扩增的洗脱液如前所述。盘子在37℃下孵育不超过18h,取无菌吸管尖的蓝色斑块,室温下孵育2h。在LB中用ER 2738隔夜培养,在3mL LB中加入1:100稀释液(30L)。在37℃下培养一夜(不摇动)。共培养1.5mL,经14,000 rpm离心10 min后测序,500 L噬菌体上清液转入新鲜管,其余1 mL再离心,上清液80%转入新鲜管(扩增噬菌体库)。在200 L PEG/NaCl培养基中加入500 L噬菌体上清液,在室温下倒置混合培养10 min。噬菌体在4°C下离心10 min,4℃离心10 min,上清液丢弃,颗粒在100 L碘化物缓冲液中重新悬浮,大力敲打试管,加入250 L乙醇,室温孵育10 min,4°C离心10 min,上清液丢弃,70%乙醇洗涤,37℃干燥,小球再悬浮于Tris/EDTA中。直接测序共用5L。
肽合成
TVRTSAE含有硫醇基(TVRTSAEGGCGG),由ArchieChem(UK)合成,与Alexa Fluor 647 C2 Maleimide(Thermo Fisher,UK)结合。TVRTSAE标记FITC(TVRTSAEGGCGG-COOH)是因诺瓦根(瑞典隆德)商业化合成的,转化为乙酸盐用于活细胞。用HPLC法和ESI-MS法分别测定肽的纯度和质量.
噬菌体结合试验
SKOV 3细胞接种于8井Nunc实验室-tek中。TMII室幻灯片(英国,热科学),密度为2×104细胞/在300升DMEM中加入10%FCS,2mmL谷氨酰胺、青霉素100 U/mL、链霉素100 g/mL。细胞在5%CO中孵育2、37°C生长至~80%汇合度(24h)。细胞用PBS清洗两次,感染2×10。10PBS/1%BSA中噬菌体总体积为100μL,在LB/IPTG/Xgal平板上滴加隔夜培养,适当稀释。细胞在4℃孵育2h,用PBS/1%BSA/0.1%吐温-20冷洗5次,与小鼠抗M13抗体(AbCAM,ab9225)孵育1:50稀释,4℃下用1%BSA稀释1h,室温下用Alexa Fluor 488山羊抗小鼠(Invitrogen,A11017)孵育细胞,在室温下稀释1:2000。细胞经低温PBS/1%BSA洗涤4次,室温下用4%PFA固定20 min。用PBS冲洗细胞,用Invitrogen(Invitrogen)标记延长金刚石的切片。
TVRTSAE肽剂量反应及细胞结合的流式细胞仪分析
SKOV 3种子密度为1×10。5在一个96井的平板中每口井的细胞。细胞用200 L洗涤缓冲液(PBS/1%BSA)和100 L含100 M、300 M或500 M TVRTSAEGGCGG肽或PBS的100 L洗涤缓冲液(PBS/1%BSA)在4°C下洗涤1h。细胞在4°C下用4%多聚甲醛浸泡1 h,4°C固定20 min,共2×10。4门控事件在BD Accuri C6(BD生物科学,美国)流式细胞仪上的FL-4频道获得,数据用BD Accuri C6软件版本1.0.264.21(Becton Dickinson,美国)进行分析。流式细胞术分析TVRTSAEGGCGG与PBS的结合。
叶酸作用下TVRTSAE肽结合细胞的免疫荧光分析
SKOV 3细胞接种于8井Nunc实验室-tek中。TMII室幻灯片(英国,热科学),密度为2×104细胞/在300升DMEM中加入10%FCS,2mmL谷氨酰胺、青霉素100 U/mL、链霉素100 g/mL。细胞在5%CO中孵育2,在37°C生长至80%左右汇合(24 H)。细胞用PBS洗涤两次,用0.5mm叶酸在PBS/1%BSA中孵育,或在4°C用总体积为300 L/孔的完全培养基孵育1h。细胞用PBS洗涤,用0.5mm FITC标记的TVRTSAEGGCGG-COOH肽在PBS/1%BSA中孵育,总体积为300 L/孔,4°C为1h。细胞经低温PBS/1%BSA洗涤4次,室温下用4%PFA固定20 min。用PBS冲洗细胞,用Invitrogen(Invitrogen)标记延长金刚石的切片。
含FRα结合肽的HAdV-C5纤维旋钮蛋白的预测模型
用瑞士人模型对含肽插入的HAdV-C5纤维旋钮的结构进行了模拟。26以HAdV-C5纤维旋钮蛋白为模板(PDB 6 HCN)的最佳晶体结构27]。结构在PyMol[28].
HAdV载体的产生
利用HAdV-C5荧光素酶表达的基因组,通过缺失早期基因(ΔE1/ΔE3),使复制缺陷的HAdV基因组产生一组重组HAdV基因组,并通过AB环中S408E和P409A的突变,使腺病毒与CAR结合的KOI突变出现。将Frα特异性肽DWSSWVYRDPQT、CIGNSNTLC和CTVRTSAEC插入到纤维旋钮的HI环中,在AB环中通过S408E和P409A导入KO1突变。重组HAdV-C5基因组大肠杆菌菌株SW 102。首先在HAdV-C5基因组中插入一个SACB选择盒,然后用每个代表FRα特异性肽的寡核苷酸序列替换。DNA的提取和纯化采用微型制备法(Chiagen)进行.采用扩增HI-Fi PCR技术,筛选出含有100 bp同源性臂的盒体和寡核苷酸(Roche应用科学,英国)。对正确克隆序列的确认通过直接DNA测序证实了使用商业测序服务。
为产生腺病毒,在10 mL培养8h内扩增出小片段DNA,隔夜加入250 mL培养物中。用BacMax 100试剂盒(Macherey-Nagel,Duren,德国)进行纯化,并在T25组织培养瓶中转染T-Rex-293细胞。细胞病变效应(CPE)产生后,用四氯乙烯对细胞进行颗粒化和病毒提取(Fisher Science,Loughborough,UK)。用5×T 150合流T-Rex-293瓶对病毒进行扩增。用两轮氯化铯(CSCL)梯度离心纯化病毒。对含10%甘油、10 mm Tris-HCl(pH 7.8)、135 mm NaCl和1mm MgCl的缓冲液进行透析,将CSCL从病毒中去除。2·6H2在1μg蛋白等于4×10的前提下,用微量二异氰酸酯(BCA)法测定O.病毒滴度。9病毒粒子(VP)
WESTERNBLOTTING
采用Westernblotting方法检测含肽插入的HAdV-C5纤维旋钮蛋白的结构完整性。共计1×1010用SDS-PAGE在预制的10%NuPAGE聚丙烯酰胺凝胶(Invitrogen,Paisley,UK)上运行VP/病毒库,通过半干法将其转移到HyBond-P-硝基纤维素膜(GE Healthcare Life Sciences,Little Chalfonn,UK)上。硝化棉膜用5mL的皮尔斯米塞尔抗体扩张剂(热科学)处理10 min,用蒸馏水冲洗7次。在含0.05%吐温-20和0.05%Triton X-100(TBS-T)的5%乳中,4°C隔夜阻断膜。在37℃下,将原代抗腺病毒纤维抗体4D2(AbCAM,ab3233)(1:2000)孵育1 h,用TBS-T洗涤5 min,用抗小鼠IgG-HRP结合物(1:2000;英国温布利生物技术有限公司)在室温下孵育1h。在TBS-T中再洗涤5分钟后,在超级信号西皮科化学发光基质(Thermo Science)中孵育10分钟,并在GelDoc autoChemi照相机(英国剑桥紫罗兰制品有限公司)上进行分析。
腺病毒介导的体外细胞转导
简而言之,细胞的密度为2×10。4细胞/井在96井板中。24小时后,细胞感染荧光素酶表达的hadv载体,剂量为5000 vp/细胞,总体积为100 vr无血清培养基,并在5%CO浓度下孵育。2取37°C培养3h,用2 0 0μL的完全培养基(RPMI 16 4 0+10%(v/v)FCS、10 0 U/mL青霉素、10 0 g/mL链霉素)代培养45h,细胞在1X细胞培养液(Promega,UK)中溶解,在−70°C冷冻,解冻细胞,用10 0L荧光素酶分析试剂在白色96孔板中混合。用多模平板阅读器(FLUOSTAR Omega,BMG LabTech,Aylesbury,UK)立即测定相对光单位(RLU)中的荧光素酶活性。用BCA法测定RLU/mg蛋白中总蛋白含量。总计2×104如前所述,门控事件在BD Accuri C6上的FL-1通道中被获取。
腺病毒标记与共聚焦显微镜
腺病毒颗粒在10%甘油/100 NM NaHCO中与过量20倍的Alexa Fluor 488-TFP(分子探针)在室温下孵育1.5h。3/PBS缓冲液,pH 7.2。用PBS缓冲液中的10%甘油交换缓冲液,用两个ZIBA自旋脱盐柱(Pierce)去除标记病毒中的未结合染料。
SKOV 3细胞接种于24孔板上,密度为2×10。4细胞/很好。2天后,在无血清培养基中加入标记腺病毒(250,000 VP/细胞),在冰上孵育45 min。将细胞转移到37°C,30或60 min后固定(2%多聚甲醛,室温12 min),渗透(0.1%Triton X-100,室温2 min),与Alexa Fluor 555 Phalloidin(Thermo Fisher)孵育。用含DAPI的南方生物技术(FluoromountG,SouthernBiotech)标记细胞核。采用63×物镜的Leica TCS SP8显微镜进行成像。利用LAX(Leica Microsystems,德国)软件对这些图像进行了分析,它们显示出最大的共焦堆栈投影。
统计分析
如有关图图所示,数据以一式三份或一式四份的形式进行。所有分析和图表都是在GraphPad Prism版本6.03中创建的(GraphPad Software Inc.,La Jolla,CA,USA)。P≤0.0 5值被认为具有统计学意义。