细菌菌株
肠沙门氏菌研究中使用了伤寒血清学株TY2(最初从印度Kasauli的CRI获得)和临床分离物(从政府医学院和医院获得,32部门、Chandigarh和整个印度医学科学研究所,新德里)。BL21(DE3)E.coli在研究过程中使用了有能力的宿主细胞。在37°C条件下(150 Rpm),在37°C条件下,将细胞在37°C下培养一夜,制备了细菌细胞悬浮液。23,24.
代理
本研究采用抗生素卡那霉素原液(50 mg/ml)、利尿肉汤(LB)和来自Himedia的琼脂。Taq聚合酶和限制性内切酶、印地语Ⅲ和NdeI等酶是从热鱼中获得的。从西格玛购买的异丙基β-D-1-硫代乙酰基吡喃糖苷(IPTG)。弗洛因德的佐剂用于西格玛。小鼠细胞因子试剂盒:肿瘤坏死因子-α是从Krishgen生物系统(印度孟买)购买的,IL-6和10从Diaclone,法国贝桑松购买.二次抗人抗体和抗鼠抗体是从印度班加罗尔的Genei购买的.
细胞培养
CaCO-2和原始的264.7细胞株(从印度浦那国家细胞科学中心获得)在37℃下用5%CO加湿培养。2...培养液为Dulbecco改良Eagle培养基(DMEM),添加5%胎牛血清、50 U/ml链霉素和100 U/ml青霉素,每2天更换一次。
动物与伦理清理
动物研究得到潘贾布大学动物伦理委员会的批准(批准号:)。PU/45/99/CPCSE/IAEC/2018/226)。本研究选用6~8周龄的近交系Balb/c雌性小鼠。所有动物都被安置在干净的聚丙烯笼子里,喂养标准的无抗生素饮食和水。所有实验议定书均经昌迪加尔潘贾布大学机构动物伦理委员会(IAEC)批准,并按照印度政府动物实验控制和监督委员会的指导方针执行。根据印度昌迪加尔潘贾布大学动物机构伦理委员会的指导方针处理和处置动物。
硅中研究和验证CdtB基因存在沙门氏菌临床分离株
的同源性。CdtB不同菌株的基因沙门氏菌对伤寒杆菌基因序列进行BLASTn分析。https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)。利用IEBD分析资源,对CdtB蛋白T细胞和B细胞免疫表位及T细胞表位免疫原性进行了预测。http://tools.iedb.org/main/)25...此外,CdtB基因验证S...伤寒杆菌TY2株和15株临床分离株。为了证实该基因的存在,在以下条件下,用5‘TGCATCGGACTGGGTAATG 3’和5‘GTCTGCTGGCTGCGATTA 3’引物进行PCR,变性95°C 30秒,58°C退火45秒,72°C延伸30秒。
质粒构建与转化
PET-28a是一种广泛用于表达重组蛋白的表达载体。简单地说,CdtB用前向5‘TAAGCATATGATGAAAACCTTTTTT 3’和反向引物5‘TCTTAAAGTTTACTCTTACTCTTCGTGCCAAAA 3’分别扩增出具有印地语Ⅲ和NdeI限制性内切酶位点的基因。放大CdtB基因和载体用热消化酶、辛地那Ⅲ酶和NdeI酶消化。经消化后,将载体和基因进行凝胶纯化,在16℃下用Takara T4 DNA连接酶进行连接30 min。重组DNA转化为E.coli利用CaCl的BL 21(DE3)宿主细胞2方法26...用碱性裂解法提取质粒,检测在含卡那霉素琼脂平板上转化的细胞是否存在重组质粒。为了证实插入到pET28a质粒中的DNA的完整性,还进行了核苷酸测序分析。从转化的BL 21(DE3)中提取载体。E.coli用琼脂凝胶纯化试剂盒纯化细胞,用T7启动子和终止子引物进行测序。
蛋白的表达与纯化
为表达CdtB蛋白,将单个转化细胞接种于含LB的新鲜抗生素中,在37°C摇床条件下过夜培养。第二天,将1%的培养接种在含LB的新鲜抗生素中,并允许在标准条件下生长,直到O.D。600达到0.4-0.6。1mm浓度IPTG诱导蛋白表达。
用硝酸镍-三乙酸(NTA)-琼脂糖层析法从包涵体中纯化了His标记的CdtB.细菌经8000 rpm离心10 min后,在结合缓冲液(20 mm Tris-Cl(PH 8),5 mm咪唑,500 mm NaCl)中进行洗涤和悬浮。悬浮液在冰上超声处理半小时,12000 rpm进一步离心20 min,收集包涵体。包涵体洗涤两次,悬浮于6M尿素中。将蛋白完全溶于尿素中孵育1h后,用12000 g离心20 min。将所得萃取物应用于Ni-NTA柱预平衡,并与含6M尿素的结合缓冲液进行了比较.柱用20 mm Tris-Cl(PH 8)、500 mm NaCl、15 mm咪唑和6M尿素洗涤。结合蛋白用含有300 mM咪唑的缓冲液洗脱,在10 mM Tris-Cl(PH 8)和100 mM NaCl下进一步透析。用10 kDa截留浓缩器浓缩蛋白质.用sds-PAGE法检测纯化蛋白的纯度。27.
体外纯化CdtB蛋白的核酸酶活性
评估体外桥联蛋白CDtB蛋白核酸酶活性的研究等人.28紧随其后的是很少的改动。2 0 0ng纯化的人DNA(用奇根DNA提取试剂盒提取)在37℃、3种不同浓度的CdtB蛋白(10 0ng、2 5 0ng和5 0 ng)中,在50 mm NaCl、2 0 mm Tris-HCl(pH7.5)、5 mm CaCl 2、5 mm MgCl 2、5 0μg/mL BSA的消化缓冲液中孵育40 min。以1%琼脂糖凝胶为原料,加入10 mm EDTA,停止反应,并对酶解产物进行分析。此外,还进行了上述蛋白质浓度的另一组实验,培养时间超过4h,在2%琼脂糖凝胶上对产物进行分析,以观察消化后的DNA片段(如果有的话)。在37℃不加CdtB的条件下培养DNA,以牛DNaseⅠ(2ng,10 min)分别作为阴性对照和阳性对照。用ImageJ软件对DNA带密度进行了测定。
用不同细胞株评价毒素(如果有的话)的不良效应
形态变化
为了研究cdtB蛋白在真核细胞中引起的形态学改变(如果有的话),采用CaCO-2(人)和RAW 264.7(小鼠)细胞株。简单地说,24小时半合流培养含4×10。4在不同浓度(1、10和100μg/ml)蛋白制剂存在下,培养1d后检测细胞/ml。显微镜下观察不同浓度的cdtB蛋白对细胞形态的影响。29.
MTT法(3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四氮唑溴)测定
采用MTT法测定细胞(CaCO-2和Raw 264.7)在蛋白质存在下的代谢活性。细胞经胰蛋白酶消化或刮除后,在1×10的培养基中稀释。4细胞/毫升,一式三份,制成微滴板。然后加入不同浓度的cdtB蛋白(1,10和100μg/ml),在适当的条件下孵育24h,加入mtd(3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四氮唑)溶液100μ1,加入2,5-二苯基四氮唑蓝溶液,回流培养4 h,4h后,每孔加入1 0 0μ1,记录吸光度,包括在5 70 nm处的吸光度。30.
细胞周期分析
采用流式细胞仪观察蛋白质对细胞周期的影响。细胞(原料264.7和CaCO-2)接种于24孔板中,密度为4×10。4细胞/ml,不同浓度的蛋白质(1,10,100μg/ml)作用24h,细胞离心,用PBS洗涤两次,悬浮于500μl的冷乙醇(70%)中,在冰上孵育15 min。固定后,将细胞悬于3 0 0mg/ml碘化丙酸丙酯(PI)溶液(0.0 5mg/ml PI;0.0 2 mg/ml RNase;0.3%TritonX;1 mg/ml柠檬酸钠)中,在冰上再孵育1h。细胞用PBS洗涤并分析。29,31.
对.的评价体内CdtB的免疫原性
实验免疫小鼠血清
用佐剂注射纯化蛋白,检测CdtB作为免疫原的潜力。一次剂量(50μg)CdtB蛋白与弗氏完全佐剂的比例为1:1,经腹腔注射给8只小鼠,然后按1:1比例混合蛋白浓度的一半(25g)的3个增强剂量,并在14时给予弗氏不完全佐剂。TH, 21TH和28TH天。对照组4只,注射PBS佐剂。第17天分别从对照组和免疫组采集血清。TH, 23TH, 30TH分别进行定量(间接ELISA)和定性(Westernblotting,仅在第二次增强后)检测和检测抗CdtBIgG抗体。
将10μg/ml的CdtB蛋白(在碳酸盐缓冲液中稀释,pH9.6)涂于4°C的微滴定板井中,每步用PBS pH7.2冲洗三次,隔夜用5%脱脂乳堵塞。第二天,分别加入1:500~1:256000不同稀释度(1:500~1:256000)的10 0份μl血清,37°C孵育1h,然后加入抗人IgG-HRP结合抗体(1:20000)μ1,在相同条件下孵育1h。潜伏期结束后,加入50μ1底物,在黑暗中显色10 min。该反应以50μl/孔(0.1nH)停止。2所以4,用微板阅读器在450 nm处读出。32,33.
WESTERNBLOTTING
为检测免疫小鼠的CdtB特异性抗体,在12%三甘氨酸SDS-PAGE凝胶上检测CdtB蛋白,并将蛋白带转移到PVDF膜上。用PBS-吐温20(0.05%)制成的5%脱脂乳在37℃下封闭2 h,37°C用1:500稀释液(封闭缓冲液)与2份血清样品(1:20000稀释)孵育1h,每次用洗涤液(pBS-T,0.05%)冲洗,37°C与抗人IgG-HRP结合抗体(1:20000稀释)孵育1h,然后用PBS-T(0.05%)冲洗,37°C与抗人IgG-HRP结合抗体(1:20000稀释)孵育1h。用显色剂tmb溶液(在黑暗中)显色10-15 min,用洗涤缓冲液冲洗停止反应。32.
设立S伤寒性腹膜炎小鼠模型
大鼠腹膜炎模型的建立S伤寒杆菌(TY2),在5%的猪粘液中通过腹腔注射。33,34,35不同剂量(10次)7, 108, 109(3)在小鼠(n=3)中标准化24h内致人死亡的剂量,以了解接种疫苗对动物生存能力的影响。对照组(n=3)给予PBS。
主动免疫
在检测了该蛋白的免疫原性后,对两组小鼠进行了主动免疫,每组8只。小鼠免疫以同样的方式(1:1)进行。圣, 14TH, 21圣和28TH日)如上文所述,后面是致命剂量的挑战(10)9(Cfu)S伤寒经腹膜内途径。其中一组记录动物在攻击后30天的存活情况,另一组用于细菌负荷研究、组织学检查和细胞因子水平评估。对照组,由4只小鼠组成,在上述天数内,仅用PBS混合佐剂,然后进行细菌攻击(作为未免疫感染的对照)。
细菌负荷的测定
对照组(未免疫感染)20 h脾脏和肝脏细菌负荷,20 h和7 h免疫感染组细菌负荷。TH检测感染后第一天。用颈脱位处死小鼠,在无菌条件下解剖取器官。将器官悬浮在无菌PBS(pH7.2)中,均匀化,铺在MacConkey琼脂平板上,37℃保温过夜。菌落形成单位数以对数表示。10CFU。
组织建筑学
未免疫组、未免疫组、未免疫组和免疫感染组的肝和脾标本无菌切除(20小时和7小时)。TH感染后第一天,用10%福尔马林缓冲液固定,用苏木精-伊红染色,显微镜下观察细胞浸润和聚集情况。36.
细胞因子估计
对照组(未免疫感染)和免疫感染组分别于20h和7h测定血清和脏器(肝、脾)中促炎因子(α和IL-6)和抗炎细胞因子(IL-10)。TH按制造商的指示使用试剂盒进行免疫感染日(α,krishgen生物系统,孟买,印度37),IL-6和10,Diaclone,Besancon,Cedex,法国38,39)。在无菌状态下采集血清和器官,并进一步测定细胞因子水平。33,40.
统计分析
实验至少进行了三次,数据表示为平均±SD。用GraphPad Prism 8软件进行统计学分析,采用学生t检验和单因素方差分析(ANOVA)评价数据的显着性。数值小于0.05(p < 0.05) were considered statistically significant.