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引物修饰的常见类型及应用(一)

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发表时间:2018-10-16 14:04作者:武汉新启迪Xinqidi来源:http://www.qidibio.com
修饰类型修饰名称特点及应用
反义DNA合成硫代硫代修饰(Phosphorthioate)的寡核苷酸主要用于反义实验中防止被核酸酶降解。您可以选择全硫代,但随着硫代碱基的增加,寡核苷酸的Tm值会降低,为了降低这种这种影响,可以对引物两端2-5个碱基进行硫代修饰,通常可以选择5'和3'各3个碱基进行硫代修饰。
2氟代核糖核酸A和G因为其比较复杂的化学结构而难于合成,一般常用的2氟代的有C和U.
2'-O-甲基核糖核酸在RNA的修饰中, 2'-O-甲基核糖核酸(2'-O-甲基-RNA)修饰普遍存在于tRNA 和其他转录后调控的小RNA中,含有2'-O-甲基核糖核酸寡核苷酸片段可以被直接合成,这个修饰可以增加RNA:RNA duplexes的Tm值,但是对于RNA:DNA的稳定性将会有微小的改变,如果期待以单链核酸的形式被进攻,他是稳定的,并且是典型的5-10个折叠,比DNA更不易与DNases相结合,作为能够稳定增加与目标信息结合能力的有效工具,2'-O-甲基核糖核酸修饰被普遍应用于反义寡核苷酸。
5-甲基脱氧胞嘧啶每个脱氧胞嘧啶被5-甲基脱氧胞嘧啶(5-Methyl Dc)取代后其熔点温度将会增加0.5℃,另外当寡核苷酸片段植入活体内引发一些不必要的免疫反应,5-甲基脱氧胞嘧啶在CpG 修饰中的出现将会阻止或限制这些反应,这一点在反义核酸应用中是非常重要的一方面。


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