细胞株与细胞培养
人乳腺癌(MDA-MB-231和MCF-7)、胚胎肾(HEK293T)、胶质母细胞瘤(U87和U 251)、肺腺癌(H 1299和A 549)、结肠癌(HCT 116和DLD-1)、肾癌(786O和RCC4)、宫颈癌(SIHA和HeLa)、卵巢癌(SKOV 3)、骨癌(U2OS)和肝细胞癌(HepG 2和Hep3B)的美国类型培养集(ATCC;Manassas,VA);人胰腺癌(MIAPaca 2和PanC 1),人前列腺癌(PC3和DU 145)和小鼠乳腺癌(MTV-TM-011)细胞系(韩国首尔)。MDA-MB-231、MCF-7、MTV-TM-011、U 251、H 1299、A 549、DU 145、PC3、786O、RCC4、HeLa、SKOV 3、U2OS和Hep3B分别在RPMI 1640、U87和HepG 2、HEK293T、MIApaca2、PanC1、DLD-1、HCT 116和HA中培养,分别加入10%的热灭活FBS。细胞生长或形态改变时,常规检查支原体污染情况。解冻后细胞的培养时间一般不超过3个月。细胞在含5%CO的加湿气氛中生长。2在37°C.荧光素酶表达,荧光素酶/KHK-A,荧光素酶/KHK-C-共表达MCF-7,MDA-MB-231和MTV-TM-011稳定的细胞系中,分别建立了G 418抗性克隆.
抗体和试剂
酮己糖激酶抑制剂PyPy(420640)是从米利波(伯灵顿,MA)购买的。培养基为FBS、D-果糖(F 3510)、D-葡萄糖(G 7021)和抗旗标抗体(F 7425,1:5000稀释度)。抗khk(sc-377411,1:500),鼻涕虫(sc-166476,1:1000),N-钙粘蛋白(sc-7939,1:1000),vimentin(sc-7558,1:1000),Zeb-1(sc-25388,1:1000),β-tubulin(sc-9104,1:5000),gst-tag(sc-138,1:1000),prps 1/2(sc100288,1:1000),醛缩酶B(sc393278,1:1000)和l-B(sc-6216,1:1000)的抗体是从圣克鲁斯生物技术公司购买的。CA);抗Importin-β(ab2811,1:1000)、α-SMA(ab7817,1:1000)、捻度(ab50581,1:1000)和蜗牛(ab53519,1:1000)的抗体(英国剑桥);抗YWHAH(9640,1:1000)、Myc-Tag(2278,1:1000)、绿色荧光蛋白(2555,1:1000)和SQSTM 1/p62(5114 T,1:1000)的抗体;来自ECM生物科学(凡尔赛,KY)的抗丝氨酸/苏氨酸(PP 2551,1:1000)和磷酪氨酸(PP 2221,1:1000)的抗体;来自Signalway抗体LRRC 59(NBP 1-93953,1:1000)和12-脂氧合酶(NBP 1-90338,1:1000)的抗体来自Novus Biologals(Littleton,CO);抗KHK-A(21708-2,1:1000)和KHK-C(21709-2,1:1000)的同型特异性抗体来自Signalway抗体LLC(Pearland,TX,美国);抗His(6)标记的抗体(PM 032,1:1000)来自MBL(名古屋,日本)。HRP-结合兔抗山羊抗体(81~1620,1:5000),抗E钙粘素(131700,1:1000)和SQSTM 1/p62磷酸-Ser28(PA5-35409,1:1000)抗体来自Thermo Fisher Science(Waltham,MA);HRP-结合山羊抗兔(G 21234,1:5000)和HRP-结合山羊抗小鼠(G21040,1:5000)来自Invitrogen(CA);抗-GLOD 4(GTX104484,1:1000)来自特克斯(圣安东尼奥)。兔抗HIF-1α抗体(1:1000)抗人HIF-1α单链肽。34。利用噬菌体展示技术,通过商业设施(Bioneer,大田,韩国),获得了一种抗S25磷酸化YWHAH单克隆抗体。合成肽RYDDMASAMKAVTE和RYDDMA(P)SAMKAVTE是从GL Biochem(中国上海)购买的,与牛血清白蛋白结合作为抗原。
质粒、siRNAs的制备及转染
人类的DNAKHK-A(NM_000221),人类KHK-C(NM_006488),人类LRC 59(NM_018509)YWHAH(又称14-3-3η;NM_(003405))采用rt-PCR技术,将其插入pcDNA-Myc、pcDNA-标志、pcDNA-gfp、pcDNA-His(6)、CMV荧光素酶/IRES或pGEX质粒中。用PCR突变法检测KHK-A和YWHAH的突变.激酶缺陷型KHK-A(KHK-A-dATP)是通过删除A.A构建的.255-260E-cadherin质粒是从Addgene(#47502;剑桥,MA)购买的.瞬时转染质粒或siRNA时,分别用脂质体3000(用于质粒)或脂质体RNAiMAX(用于siRNA)转染融合率为70%的细胞。转染后的细胞在实验前稳定48h。补充表中概述了siRNAs的核苷酸序列。1.
慢病毒载体稳定细胞系的建立
小鼠慢病毒载体KHK-a-基因制药(中国上海)产生了沉默的shRNA。将寡核苷酸退火后插入shRNA表达载体pGLVU 6/Puro。ShRNA序列(补充表)2)被设计成针对老鼠的编码区域。KHK-a(NM_001349066)。含病毒上清液取自HEK293T细胞,800×离心。g和过滤。滤液与含PEG-8000的浓缩液在4°C下隔夜孵育,在1600×离心条件下离心。g60 min后,病毒颗粒在pBS中重新悬浮,应用于MTV-TM/011细胞。用1μg/mL普罗霉素筛选转染细胞。为获得稳定的肿瘤移植细胞株,将MTV-TM/011细胞集落组合在一起。补充表中概述了shRNAs的核苷酸序列。2.
乳腺癌异种移植
所有动物实验都是在首尔国立大学动物保护和使用委员会(批准号:)批准的协议提案下进行的。170721-1-5;190712-2-1;190819-1)。用G 418筛选出携带CMV荧光素酶-IRES-gfp质粒或CMV荧光素酶-IRES-KHK-A质粒的MTV-TM-011细胞株;用sh-gfp质粒筛选CMV荧光素酶-IRES-gfp质粒。KHK-a(或sh-对照),或cmv荧光素酶-IRES-khk-C质粒与sh-KHK-a用G 418和普罗霉素筛选CMV荧光素酶-IRES-GFP质粒,用G 418和Zeocin筛选His-YWHAH_ST25A或His-YWHAH_S25A质粒。将这些细胞植入雌性小鼠(8周龄,Balb/CSLC-nu/nu)右下乳腺脂肪垫中。制表水或15%果糖(或葡萄糖)的水是提供的Libitum。用异氟醚麻醉小鼠,腹腔注射维沃格洛荧光素溶液(40 mg/mL)(Promega,Madison,WI)100μL,获得肿瘤的活体图像。10 min后,用XenogenIVIS 100采集图像,用LivingImage2.50.1软件(Xenogen,Alameda,CA)进行分析。植入后2周,每周三次监测原发肿瘤生长情况。当平均原发肿瘤体积达到500-600 mm时3切除原发肿瘤,监测肿瘤转移3周。收集主要脏器(肺、肝、心、脾、脑、肾、后腿、胃肠道),以确定肿瘤转移情况。
细胞侵袭试验
为评估细胞浸润情况,采用8μm孔径的Matrigel包膜隔开Transwell室。细胞接种于无血清培养基上,密度为2×10。4(H 1299,A 549和MDA-MB-231),3×104(U87、U 251、DU 145、DLD-1、HCT 116、786 O、RCC 4、SIHA和HeLa),4×104(Mcf-7和U2OS),6×104(MIAPaca 2、PanC1和MTV-TM-011),或7×104(PC3和HepG 2)细胞/好,在下腔内放置含FBS的培养基。细胞孵育18h后,用4%多聚甲醛固定,苏木精和伊红染色。滤镜上部的细胞用棉签去除,向下侵入的细胞在BX53-P偏光显微镜下被观察和拍摄(奥林巴斯,日本东京)。利用ImageJ软件(NIH,Bethesda,MD)对入侵细胞进行计数。
重组蛋白的制备
重组GST-KHK-A,GST-YWHAH和游离GST蛋白在大肠杆菌BL 21细胞,用谷胱甘肽亲和珠(GE Healthcare;芝加哥,IL)在4°C作用1h,用10 mm还原谷胱甘肽(Sigma-Aldrich)洗脱。在HEK293T细胞中表达标志-LRC 59和His(6)-KHK-A蛋白,分别用EZview红旗(Sigma-Aldrich)和镍-NTA(Chiagen,Hilden,德国)亲和珠在4°C下洗脱4h,分别用500 ng/μL的标志肽和250 mm咪唑洗脱。用SDS-PAGE和考马斯亮蓝R-250染色法检测蛋白质的含量和纯度.
体外结合试验
纯化的his-khk-A和旗标-lrrc 59或gst-yWHAH的混合物在一个结合缓冲液(25 mm HEPES/pH 7.5,150 mm kCl,12.5 mm MgCl)中孵育。20.5 mm DTT、0.1%NP-40和10%甘油)在4°C作用1h,加入或不加1mm果糖,在4°C下与镍-NTA亲和珠进一步孵育1h,经结合缓冲液洗涤后,在变性SDS样品缓冲液中洗脱结合蛋白,进行Westernblotting。
体外激酶测定
重组His-KHK-A(10 Ng)或His-KHK-C(10 Ng)和GST-YWHAH(5 0 Ng)在含50 mm Tris-HCl/pH 7.5,100 mm KCl,50 mm MgCl的激酶缓冲液的30μL中2,1mm邻苯二甲酸钠,DTT 1mm,甘油10%,ATP 2mm。反应在37℃下孵育1h,在SDS缓冲液中加热结束。蛋白质磷酸化采用Westernblotting方法。
定量RT-PCR
用TRIZOL(Invitrogen,Carlsbad,CA)提取总RNA,在42°C下反向转录60 min,加入M-MLV逆转录酶(Enzynology,Daejeon,Korea)、RNase抑制剂、dNTP和随机引物。在qPCR主成分(Enzynome)中进行实时PCR,cfx连接实时Cycler(Bio-RAD,Hercules,CA)监测染料-DNA复合物的荧光发射.目标基因的mRNA值按GAPDH的表达进行归一化。所有反应均为三重反应。在补充表中总结了实时定量PCR中使用的引物。3.
染色质免疫沉淀
细胞以1%甲醛固定,37°C固定10 min,用含蛋白酶抑制剂的PBS冷洗。细胞经0.5%NP-40裂解后,用1%SDS提取细胞核,经超声处理,将基因组DNA切成300-500 bp片段。在4°C下,用抗旗标、抗鼻塞、抗钉螺或抗YWHAH抗体沉淀可溶性染色质复合物,在4℃下用蛋白A/G珠(Santa Cruz生物技术)沉淀免疫复合物2 h,用低盐、高盐、LiCl和TE溶液依次洗涤。结合染色质复合物在芯片直接洗脱缓冲液中洗脱15 min,在65°C下孵育一夜,进行反向交联。用苯酚-氯仿提取DNA,乙醇沉淀.将沉淀后的DNA在蒸馏水中溶解,用qPCR(95°C/55°C/72°C,每相20s)进行分析。PCR引物的核苷酸序列(5‘~3’)为GCGCTGCTGATTGCTGTG和GGCTGGAGTCTGAACTGAC。Cdh 1启动子。芯片-qPCR结果表示为输入信号的百分比(%输入).所有反应均为三重反应。
细胞质和核成分的分馏
细胞离心量为1000×g在含10 mm Tris/HCl(pH7.4)、10 mm KCl、1mm EDTA、1.5mm MgCl的裂解缓冲液中均匀化5 min。2,0.2%NP-40,0.5mm DTT,1mm正丁酸钠,400μMPMSF。用1000×离心法将细胞裂解液分离成小球(核组分)和上清液(胞浆组分)。g持续5分钟。核萃取缓冲液(20 mm Tris/HCl,pH 7.4,420 mm NaCl,1毫米EDTA,1.5毫米MgCl)2在球团中加入20%甘油、0.5mm DTT、1mm正丁酸钠和400μMpMSF,在冰上间歇旋转30 min。核组分和胞质组分的纺丝速度为20,000×g保存10 min,存放在−70°C。
免疫印迹和免疫沉淀
在SDS/PAGE上分离蛋白质,并将其转移到固定化-P膜(Milli孔隙,Bedford,MA)上.用5%脱脂乳阻断膜,用一次抗体在4℃孵育隔夜,用辣根过氧化物酶(HRP)结合抗体孵育1h,用ECL+试剂盒(AmericshimBiosciations,Piscataway,NJ)观察。未修剪的斑点出现在补充图中。14。为分析蛋白质的相互作用,将细胞裂解液与抗KHK、抗YWHAH或IgG在4℃下隔夜孵育,用蛋白A/G珠将免疫复合物拉下。另外,细胞裂解液与EZview红抗Myc或抗标志亲和凝胶或镍-NTA亲和珠在4℃下孵育4h,将结合蛋白在变性SDS样品缓冲液中洗脱并载入SDS-PAGE。所有的西方印迹实验都进行了三次或更多次。
免疫荧光分析
将KHK-A和KHK-C cDNA融合到GFP的C端,在488 nm处用卡尔蔡司LSM 510共聚焦显微镜观察。用3.7%甲醛固定10 min,0.1%TritonX-100固定30 min,检测LRC 59和YWHAH的亚细胞定位。细胞在含0.05%吐温-20和3%BSA的PBS中孵育1h,在4°C下用一次抗体进一步孵育。将细胞与Alexa Fluor 594结合二次抗体孵育1h,用Alexa Fluor 633 phalloidin(Invitrogen)孵育30 min,DAPI(Sigma-Aldrich)染色30 min,装于法拉多水贴壁培养基(DAKO,Glostrup,丹麦)中,共聚焦显微镜观察。
免疫组织化学
将小鼠原发肿瘤和肺组织用4%多聚甲醛固定,石蜡包埋,切成4μm切片.在60°C干燥烤箱中孵育1 h,脱石蜡,再水化,在121℃柠檬酸缓冲液(DAKO)中孵育10 min,提取抗原。阻止非特定信号。玻片用3%H孵育。2O2在BSA溶液中用2%马血清孵育15 min,用抗KHK(1:100,Santa Cruz)、抗LRC 59(1:100,Novus生物制剂)或抗E钙粘素(1:200,Thermo Fisher Science)在4℃孵育一夜。切片用二次抗体生物素化1h,免疫复合物用威他他汀ABC试剂盒(载体实验室)和民建联检测试剂盒(DAKO)显示。最后用苏木精染色15 min,在每张幻灯片的4个高功率场下拍照。
蛋白质互作体的质量分析
用空载体His-KHK-A或His-KHK-C转染Mcf-7和MDA-MB-231细胞,用5 mm果糖孵育8h,细胞裂解液与镍-NTA微球在4℃下孵育4h,用250 mm咪唑洗脱结合蛋白。用BCA试剂盒(ThermoFisher Science,Rockford,IL.)测定滑槽的蛋白质浓度。用30K阿米孔超离心过滤机(英国米利孔)进行助滤样品制备后,在纳米级易-nLC 1000系统(丹麦欧登塞,Proxeon生物系统)上分离多肽,该系统配有填料柱(100μm颗粒,75μm×50 cm)。流速为300 nL/min,流速为300 nL/min,流速为300 nL/min,流速为90 min,梯度范围为5%~30%乙腈与0.1%甲酸。用四极轨道差质谱(Q-Exactive,ThermoFisher Science,San Jose,CA)对电离肽进行了分析.在dda模式下测量了ms1光谱,分辨率为70,000。M/z扫描范围为300-1800。对于MS2光谱,多肽被高能碰撞离解(HCD)碎裂,归一化碰撞能为30,分辨率为17,500。使用Maxquant(ver.1.5.5.1)对用于无标签量化的原始MS数据文件进行处理,以与uniprotKB Fasta数据库匹配(74 540个条目,2014年6月版本)。MS/MS峰的搜索参数如下:肽长至少为6个氨基酸,固定的甲胺基修饰,可变的蛋氨酸氧化和可变的N端乙酰化。主搜索和首次搜索的容忍度分别为6 ppm和20 ppm。在所有蛋白质和肽的搜索中,错误发现率为1%。
质量分析以识别翻译后的修改
LC-MS/MS分析细胞内YWHAH蛋白,转染过表达或敲除KHK-A的MDA-MB-231细胞,再用5mm果糖处理24h,标记亲和珠纯化,SDS-PAGE。对YWHAH在体外磷酸化的LC-MS/MS分析,用SDS-PAGE法分离了GST-KHK-A与GST-KHK-A反应的重组GST-YWHAH。用胰蛋白酶消化凝胶切片中的蛋白质,并将其负载到简单的n-LC(Thermo Fisher,San Jose,CA).样品在C18纳米孔柱(150 mm×0.1mm,3μm孔径;Agilent)上分离。流动相A为0.1%甲酸,3%乙腈为去离子水,B为乙腈中0.1%甲酸。色谱梯度在40 min内从5%B增加到55%B,5 2%B到75%B在4 min,95%B在4 min,3%B在6 min。流速保持在1500 nL/min。利用配备纳米电喷雾源的LTQ轨道RAP XL质谱仪(ThermoFisher)对质谱进行了分析。质谱采用全质量扫描数据相关采集(350-1200)。M/z其次是10次MS/MS扫描。对于MS1全扫描,轨道分辨力为30,000,AGC为2×10。5。对于LTQ中的MS/MS,AGC为1×10。4。用78道尔顿在消化肽上的附加质量来鉴定磷酸化。利用蛋白质组发现者(V1.2.0.208用SEQUEST算法)鉴定修饰氨基酸。MS/MS光谱和检测到的碎片离子表现在补充图中。15和16.
果糖和1-磷酸果糖的质量分析
将mcf-7和mda-mbb-231细胞与不含5mm果糖的mdma-7细胞孵育4h,在低渗溶液中以0.6%np-40在冰上缓慢匀浆,1000×离心。g而球团则被保存为核子分数。上清液离心10,000×g并以细胞质分数的形式收集。用冰冷萃取溶剂(乙腈:甲醇:水=4:4:2,v/v/v)对细胞质和核组分进行1 min的离心,在液氮中快速冷冻1 min,然后以10,000×分离心。g15分钟。样品经SpeedVac真空离心蒸发。用50μL盐酸甲氧基胺(20 mg/mL)在30℃下衍生90 min,再用70μl N-甲基-N-(三甲基硅基)三氟乙酰胺在60°C下衍生30 min。将衍生样品应用于LECLEC-PEGASUS(TOF)MS(LECO公司,英国爱丁堡),并配以Agilent 6890 GC(Agilent Technologies),配置一个30米长的0.25mm RTX-5 Sil MS柱。色谱条件为恒流1mL/min,温度由50℃提高到330°C,流速为20°C/min。电子电离和离子源温度分别为−70 eV和250°C。为了测定果糖-1-磷酸,细胞被收集在500μL的冰冷乙醇中,用400μL的氯仿作有力的涡旋,与150μL的水混合,然后在10,000×10,000的条件下离心。g15分钟。对含有极性代谢物的上相进行了衍生化,并应用于GC-MS分析。果糖-1-磷酸被量化使用标准化学品(MF 03840)提供的碳合成有限公司(伯克希尔,英国)。
KHK-A-YWHAH反应动力学参数
10 ng重组gst-khk-A和不同量的gst-yWHAH与不同浓度的果糖共同孵育于含1mm原代戊酸钠、2mM atp和10μci(γ-)的激酶缓冲液的51μL中。32P]-ATP反应在37℃下孵育10 min,加入10%冰冷三氯乙酸结束反应。沉淀后的蛋白质在15,000×g,用冰凉的丙酮洗三次。用闪烁计数器测量了球团中的放射性。这个Km在1/C.P.M.的地块中计算出YWHAH的KHK-A值。对1/[YWHAH]根据莱恩韦弗-伯克方程。这个Ki用GraphPad Prism 5.0软件对KHK-A介导的YWHAH磷酸化过程中果糖的竞争抑制模型进行拟合。数据代表了三个独立实验的手段。测量集成电路50果糖对KHK-A-YWHAH反应、10 ng GST-KHK-A和1μg GST-YWHAH与不同浓度果糖在37℃反应缓冲液51μL中孵育10 min。集成电路50用GraphPad Prism 5.0软件从KHK-A酶活性与对数[果糖]的关系图中计算。数据代表了三个独立实验的手段。
确定KdKHK-A和KHK-C制果糖
重组His-KHK-A或His-KHK-C(10 Ng)及不同浓度的D-[14C(U)]-果糖(ARC 0116 A,美国放射性标记化学品,圣路易斯,MO)混合在30μL 25 mm HEPES或50 mm磷酸盐缓冲液(pH 7.5)中,含85 mm KCl、17 mm NaCl、1 mm MgCl。2,以及0.2毫米CaCl2。混合物在37℃下孵育10 min,加入10%冰冷三氯乙酸结束反应。沉淀后的蛋白质在15,000×g,用冰凉的丙酮洗三次。用闪烁计数器测量了颗粒中蛋白质结合果糖的放射性。Kd用GraphPad棱镜5.0软件对果糖进行了拟合。
人乳腺癌组织芯片
人类乳腺癌组织微阵列,包含40个不同的乳腺癌标本,被购买在超级生物芯片实验室(首尔,韩国)。该公司还提供了临床记录,包括性别、年龄、TNM分期、组织学分级、存活和死亡原因。根据布卢姆-理查德系统的诺丁汉改良法确定组织学分级.临床资料见补充表。4。为了对免疫染色标本中的蛋白表达进行评分,两名检查人员在每一张幻灯片上观察了四个高功率场。用组织核心分析蛋白表达,反映细胞核染色强度(分级为0,非染色;1,弱;2,中度;3,强)和阳性细胞百分比。可能的分数范围从0到300。临床资料见补充表。4.
ROS测量
Mdf-7和mda-mbb-231细胞分别转染了myc-khk-A、myc-khk-c质粒或siRNA,分别与含或不含4 0 0nM嘧啶的mdf-7和mda-mb-231细胞共孵育20μM的H。2O2作为ROS生产的阳性对照。与果糖孵育后,细胞内加入DCF-DA(20μM).细胞在黑暗中孵育20分钟后,在PBS中清洗两次,并应用于TECAN无限大M 200 PRO(奥地利格罗迪格)。DCF荧光在488 nm处激发,524 nm处检测到。
分子动力学模拟
用全原子原子分子动力学(MD)模型模拟了YWHAH-11/ATP/KHK-A三元配合物体系。以PDB ID:2hw1和2c63为原料,通过修饰KHK-A/果糖/腺苷基-50-酰亚胺二磷酸和YWHAH,制备了作为受体配体对的KHK-A/ATP和YWHAH-11。29,35。使用十六进制软件包进行了分子对接(版本8.0.0)36通过球极傅里叶算法随机更新配体和受体分子的坐标,生成配体(YWHAH-11)-受体(KHK-A/ATP)构象系综。37。在对接过程中,配体和受体分子保持刚性。在产生的配体受体结构中,初始结构选择了能量分数最高的最有利结构。在周期边界条件下,用100 mm NaCl的TIP3P水分子溶解所选择的结构。在310 K和1 bar条件下,利用gromacs软件包进行npt集成md模拟,使溶剂体系平衡10 ns。38(5.1.2版)与CHARMM 36力场39。改进的Berendsen恒温器40和Parrinello-Rahman Barostat41用于维持温度和压力。在平衡后,从以前的平衡模拟得到的轨迹结束开始,通过将yWHAH-11的s25-OH的氧向atp-γpo的磷方向拉伸,进行了转向md模拟。3使用1000 kJ mol的弹簧常数超过1ns−1NM−2拉速为0.001 nm−1得到S25-OH向ATP-γPO的运动轨迹3通过位置约束算法将ATP固定为固定基准。使用这个轨迹从拉力模拟,配置有不同的d以间隔0.1nm作为伞式取样的起始结构,随后进行了10 ns的NPT-系综MD。最后采用加权直方图分析方法(WHAM)得到PMF剖面。42。我们为每个剖面进行了五组完全独立的伞式模拟,以检查其可重复性。在此基础上,利用200 Bootsps的贝叶斯自举分析方法,利用重采样技术对剖面的不确定性进行了估计。对YWHAH-11/ATP/KHK-C、PRPS1-11/ATP/KHK-A和YWHAH-11D21A/ATP/KHK-A进行了上述模拟计算。
基于TCGA数据集的KHK异构体分析
利用肿瘤基因组图谱(TCGA)的数据分析KHK-A和KHK-C在人类肿瘤中的表达.从宽频研究所FireBrowse门户下载的原始数据(RNAseqV2级,RSEM标准化的转录异构体数据)43。对象的UCSC异构体标识符。KHK在UCSC基因组浏览器中,基因的第3外显子位置(KHK-A为uc002ril.3;KHK-C为uc002rim.3)。